A criação do Curso de Mestrado e Doutorado em Medicina e Saúde Humana (CPgMSH) é conseqüência do processo Reconfiguração Curricular e Capacitação de Pessoal que se consolidou no Projeto de Educação Continuada, da EBMSP/FBDC, iniciado em 1999, e culminou, em 2005, com a obtenção do conceito máximo de qualificação pelo MEC, em termos de estrutura física, corpo docente e projeto pedagógico.

  O Curso de Pós-graduação Stricto Sensu foi recomendado pela Capes, de acordo com a Portaria Ministerial nº 2264 de 19/12/1997, mas só iniciou suas atividades docentes no ano 2000 como um Curso de Mestrado e Doutorado em Medicina Interna (CPgMI). Conceito CAPES - triênio 2004/2006, 04 (quatro), chancelado pelo CTC e pela Comissão de Área da CAPES em 09/10/2007.